О проекте

Генетические и биологические (зоологические и ботанические) коллекции Российской Федерации

О проекте

В последние годы в связи с бурным развитием биотехнологии резко меняется ситуация с сохранением генетических ресурсов ex situ (в коллекциях). Во-первых, появляются новые виды генетических ресурсов - библиотеки генов и ДНК. Во-вторых, резко возрастает количество ресурсов, создаваемых в процессе научной деятельности. В-третьих, генетический материал самых различных организмов активно используется для создания новых лекарственных препаратов, биотехнологий и прочих товаров и услуг, что существенно расширяет круг объектов, включаемых в понятие генетические ресурсы, и существенно повышает их экономическую ценность.

В России коллекции, обеспечивающие хранение генетического и биологического материала, представлены самостоятельными специализированными организациями - Ботанические сады РАН, структурными подразделениями научно-исследовательских организаций (коллекции микроорганизмов и клеточных культур), рабочими коллекциями лабораторий, ведущих исследования в области генетики и селекции, а также рядом организаций, для которых хранение генетического материала не является основной функцией (питомники, зверофермы, зоопарки и т.п.). Эти организации принадлежат различным ведомствам (в т.ч. РАН, РАМН, РАСХН, Минсельхоз России, Минобразования и науки России, Минздрав России, Минобороны России).

Для надежного сохранения генетических ресурсов и обеспечения их эффективного и биобезопасного использования в научных и коммерческих целях в интересах страны необходима единая государственная информационная политика.

Необходимость создания информационного портала по доступу генетическим и биологическим коллекциям диктуется тем, что биологические ресурсы сосредоточены в организациях многих министерств и ведомств, разрозненные действия которых при отсутствии единой стратегии информационной политики нередко препятствуют рациональному сохранению и эффективному использованию биоресурсов, угрожают невосполнимыми потерями генетических коллекций и природных экосистем.

ОСНОВНАЯ ЦЕЛЬ – создание информационной системы по генетическим и биологическим (зоологическим и ботаническим) коллекциям Российской Федерации в виде общедоступного WEB - сервера, предназначенного для выполнения ключевых функций по проблеме инвентаризации и документирования генетических ресурсов в Российской Федерации и удовлетворения информационных потребностей федеральных органов власти, научного сообщества, международных и национальных общественных организаций.

Основные задачи - четкая координация и создание функционирующего информационного портала по информационным ресурсам с целью разработки единой Российской стратегии и политики в деле сохранения и использования генетических ресурсов. До реализации данного проекта создание полнофункциональных проблемно-ориентированных информационных систем и интегрированных баз данных в рамках инвентаризации и документирования генетических и биологических коллекций в России носило фрагментарный характер. Концептуальные, логические и физические структуры данных, программное и техническое обеспечение определяются частными задачами и возможностями научного и производственного подразделения, где создавались информационные системы, базы данных и WEB - сайты. На основе существующего задела, имеющегося в институтах и ведомствах Российской Академии Наук, Минсельхоза России, Минздрава России, МПР России, Минобразования и науки России, Российской академии сельскохозяйственных наук и Российской академии медицинских наук впервые в России создана единая информационная система по коллекциям России.

Для достижения цели решены следующие задачи:

• Разработана общая концепция создания программного обеспечения для представления генетических и биологических коллекций в рамках глобальной сети ИНТЕРНЕТ.
• Проведена инвентаризация генетических ресурсов и выявлены особенности коллекций.
• Разработана концепция классификации коллекций по характеру и объему выполняемых ими задач.
• Подготовлены рекомендации по четкой онлайновой координации и созданию функционирующего информационного портала по информационным ресурсам с целью разработки единой Российской стратегии и политики в деле сохранения и использования генетических и биологических коллекций.
• Разработаны программные средства WEB-сайта и информационного портала по коллекциям.
• Разработана технология и программные средства для добавления, изменения и представления новых коллекций в во всех разделах портала.

Основанием для выполнения работы было решение Федерального агентства по науке и инновациям 2004 года о проведении инвентаризации имеющихся в стране генетических и биологических коллекций, анализе сложившейся практики их функционирования и создании единой информационной системы.

В основу создаваемых баз данных положена интегрированная информационная система, работающая в сети Интернет на основе клиент - серверных технологий с использованием INTERBASE SQL-сервер, MS-SQL –сервер и др. Структурно БД объединяет централизованные мета- и реальные данные по генетическим ресурсам России, и децентрализованные данные, существующие в различных организациях министерств и ведомств РФ. Основной принцип, использованный в системе, состоял в создании удобных WWW интерфейсов для работы различных специалистов по созданию и актуализации баз данных (создание и динамическая поддержка). Информационный портал и базы данных расположены на информационных серверах ИПЭЭ РАН и соисполнителей проекта в форматах различных SQL серверов (Windows 2000/2003 Server, Linux, UNIX – FreeBSD, Solaris) с использованием реляционной модели данных.

В процессе выполнения проекта нами были созданы отдельные, обновленные зеркальные WEB-сайты основных исполнителей проекта (Институт биохимии и физиологии микроорганизмов им. Г.К. Скрябина Российской академии наук - ИБХМ РАН, Институт цитологии Российской академии наук - ИНЦ РАН, Ботнический сад Петрозаводского государственного университета; Институт проблем экологии и эволюции им. А.Н. Северцова Российской академии наук - ИПЭЭ РАН) и централизованный WEB-портал по биологическим и генетическим коллекциям.