Фундаментальная Экология

Биологический факультет МГУ, кафедра общей экологии

Научный семинар

Популяционная и системная экология
Руководители:проф. Замолодчиков Дмитрий Геннадьевич
 проф. Полищук Леонард Владимирович
Секретарьк.т.н., с.н.с. Будилова Елена Вениаминовна
  
Сегодня 

 Архив семинаров
 Авторы докладов
 Как доехать...

На главную страницу


Послать приглашение на семинар
  
 





Сергей Геннадьевич Баранов

(Владимирский государственный гуманитарный университет)

Морфометрический метод анализа флуктуирующей асимметрии растений


Доклад состоится в четверг 2 октября в 17:15 в ауд. 557 Биофака МГУ


АННОТАЦИЯ


Билатеральная асимметрия – один из видов асимметрии живых организмов.

Помимо флуктуирующей асимметрии (ФА) различают антисимметрию (АнС) и направленную асимметрию (НА). Считается, что ФА (незначительные и случайные (ненаправленные) отклонения от строгой билатеральной симметрии биообъектов (Захаров, 1987; Mather, 1953)) отражает стабильность развития организма и, следовательно, средовое воздействие на его фенотип. По мнению ряда исследователей (например, Р.Палмер, 1996, 2003) АнС и НА представляют генотипические особенности организма и способны наследоваться. Учитывая, что три вида асимметрии часто представлены в одной изучаемой популяции или группе генетически однородных образцов, исследования проводятся с изучением всех трёх видов асимметрии и имеют серьёзный научный интерес для изучения экологического состояния территорий, для решения вопросов популяционной генетики и проблем эволюции.

Существуют широко принятые методики изучения стабильности развития растений, так же как и насекомых, рыб, птиц, млекопитающих (Захаров и др., 2003). Используется коэффициент асимметрии, выражающийся в разности между промерами или счётными характеристиками правой и левой сторон организма (органа), например, листовой пластины растения, и нормирование разности путём деления на сумму этих величин. При этом используются крупные выборки с заведомым предположением о нормальности распределения. Существуют методы с использованием нормализации выборок, удалением выбросов, удалением выборок с высокими эксцессами и асимметричностью частотного распределения. Популярным методом является двухфакторный дисперсионный анализ (взаимодействие факторов «сторона» х «генотип») с определением компонентов дисперсии и тестированием ошибки измерения, позволяющий вычленить НА. При этом АнС выбраковывается при превышении эксцесса выборки, превышающего табличные (полученные при многократном моделировании). Другие методы основаны на вычислении площади или других характеристик левой и правой сторон листовой пластины. Около 20 лет назад появилось новое направление – геометрическая морфометрия. Преимуществами метода являются: отсутствие трудностей с выбором билатеральных парных признаков, сопоставление сторон с позиций их геометрических характеристик формы и размера. В докладе предлагается использование метода гармонического анализа на основе разложения в ряд Фурье координат ключевых точек. После определения ключевых точек строится геометрическая билатерально-симметричная модель. Для этого координаты каждой из шести точек разлагаются в гармонический ряд Фурье. Аргументами функции служат углы, образованные лучами к центру фигуры. Функция разлагается на три гармоники, представляющие собой в геометрическом виде три шестиугольные фигуры. Далее эти фигуры накладываются друг на друга, и методом наименьших квадратов координат строится билатерально-симметричная модель. Находится среднеквадратичное отклонение парных точек реального цикла от соответствующих точек в построенной модели. После этого проводится двухфакторный дисперсионный анализ значений (GR - GL), где GL, GR - среднеквадратичные отклонения точек от соответствующих точек в модели. Определяется индекс ФА как разность между средним квадратом взаимодействия факторов с кодовыми значениями «сторона» х «генотип» и ошибкой измерения (двухфакторный дисперсионный анализ). Считаем, что данный метод имеет преимущества т.к. он а)менее трудоемок, б)отражает не только размеры признаков, но и форму объекта и в)более чувствителен в силу своей интегральности. Работа выполнена на примере листовых пластин популяций Березы повислой, собранных в Иркутской области в районе действия алюминиевого завода.



Sergey Baranov


MORPHOMETRIC METHOD FOR DETECTION FLUCTUATING ASYMMETRY IN PLANTS


SUMMARY


Bilateral asymmetry is one of the kinds for organism body asymmetry. Fluctuating asymmetries are small, random deviations from symmetry of bilaterally symmetrical traits. Aside from fluctuating asymmetry there are two other forms of asymmetry. Directional asymmetry (DA) is a pattern of variation of (R - L) where the variation is normallydistributed about a mean that is significantly differing from zero. Antisymmetry (AnS) is a pattern of variation of (R - L) where the variation is distributed about a mean of zero, but the frequency distribution departs from normality in the direction of platykurtosis or bimodality. It is widely known FA reflects development stability, including environmental effect on phenotype. Some researches consider DA and AnS can be inherited.

Assuming three kinds asymmetry are present in one population or sample group equal genetically the investigation for three kinds asymmetry are provided. They attract serious scientific interest for solving tasks for population genetics and evolution.

There are some popular methods for study developmental stability (instability) plants, insects, fishes, and mammalians. Conventional FA indexes is R – L //(R + L), where R and L are right and left value metrical as well numerical. Such a normalized difference applies for tree leaves too. As a rule the large variables is used assuming a data normal distribution.Well known methods for normalization, rejection outliers, with follow rejection variables with high kurtosis and skew.

One of the popular method is two way ANOVA (side x genotype) testing components whole dispersion and measuring error. Some methods are based on circulating area or other characteristics bilateral traits. Geometric morphometrics (GM) is a new approach, raised 10 years ago.

This approach implies multivariate analysis of landmark coordinates located following certain rules on the surface of a morphological object. The aim of GM is to reveal differences between morphological objects by their shapes.

GM methods have some advantages. They are no need bilateral traits choose, differences between morphological objects by their shapes, the "size factor" being excluded. In report I consider to apply geometric morphometrics with Foure rows, when coordinates of landmarks distributes on some harmonics. The function arguments are the anglers from center to landmarks.

Every harmonics is bilaterally symmetrical. Then they superimposed by least squares method and centroid came out, it is compared with real cycle. The comparison was fulfilled as 2 way ANOVA (side x individual) variety (GR - GL), where GR is a mean square deviation between real and centroid landmarks on the right side, GL is a mean square deviation between real and centroid landmarks on the left side. Indexes FA were detected for two pairs landmarks and were compared with canonical 2 way ANOVA indexes ("side" x "individual", side is fixed, individual – is random).

I think this method has integrative advantages, as I compared three measured traits and only two pair landmarks. The results were the same or correlated. The work was been done with leaves birch trees from Ircutsk region within aluminum factory pollution area.




Фундаментальная экология
Как связаться
Контактные телефоны: 939-3872; 939-5364
seminar_fundecology@sevin.ru e-mail: seminar_fundecology@sevin.ru
Новости   |   Научные семинары   |   Научные коллективы   |   Экология человека   |   Диссертации   
   Учебные материалы   |   Конференции   |   Книжная полка   |   Выставки   |   Полезные адреса   |   О проекте   
На главную страницу    Статистика