Экосистема - это не набор случайных элементов, а, прежде всего, система, состоящая из элементов, находящихся в связях и отношениях, образующих целостность, единство, имеющее специфичное строение, функционирование и развитие. Экосистемы занимают место в реальном пространстве, которое отличается от пространства факторов тем, что в нём в каждой точке может существовать только один объект, а не любое их число. Чем более интегрирована система, тем четче её границы и легче выделить её на местности. В настоящее время экосистемы выделяют произвольно, в лучшем случае группировкой проб (описаний и т.п.), по их сходству, при этом динамику считают отсутствующей. Эти методы не позволяют отделить правдоподобные экстраполяции от правомочных. В зоологии при таком подходе выделяли бы типы бластул, гаструл и т.п., в ботанике - типы семян, деревьев и трав. В результате до сих пор нет карты экосистем России и даже нет единого мнения о том, как её получить. А биологи незатейливо используют выделы географов, для которых биотическая компонента второстепенна, а то и вовсе необязательна. Тем же грешат и опубликованные за границей карты "экорегионов".

Между тем можно зайти с другого конца, используя методы биогеографии. Экосистемы различаются видовым составом. Поэтому границы экосистем будут те же, что и у ареалов видов, различных в соседствующих экосистемах. Однако число таких видов может быть невелико, поэтому обнаружить их можно только при точном видовом определении.

Жирков И.А. 2017. Био-география. Общая и частная: суши, моря и континентальных водоёмов. - KMK Scientific Press. 568 с. https://drive.google.com/file/d/0BwHD54JPE9SzTlI4TFhjaXFkbjg/view