Зоологическая коллекция
В настоящее время депозитарий музея насчитывает более 300 тыс. единиц хранения. Коллекция зоогельминтов включает более 4 тыс. идентифицированных видов - паразитов животных и большое число форм, определенных только до рода или надродового уровня. Коллекции типового материала представлены 5 классами паразитических червей. Данные по типовому материалу (коллекция новых видов), систематической коллекции трематод и цестод, занесены в компьютерную Базу данных, которая насчитывает более 17000 тыс. записей и опубликованы в 4-х томном каталоге (2009, 2011, 2012, 20013-14). К настоящему времени Центр паразитологии располагает коллекциями зоогельминтов из: Беловежской Пущи, Республик Коми и Карелии, дельты Волги, Дагестана, озер Чаны и Байкал, Кулундинской степи и Алтайского края, из среднего течения и низовий Оби и Енисея, республик Тыва и Саха-Якутия, Приморского и Хабаровского краев, Камчатки, Чукотки, Колымы, Грузии, Кыргызстана, Туркменистана, Северного Вьетнама и Монголии.
Классы зоогельминтов, представленные в наших коллекциях
| Класс № | Название класса |
| 1 | Acanthocephala |
| 2 | Trematoda |
| 3 | Cestoda |
| 4 | Nematoda |
| 5 | Monogenoidea |
Количество видов зоогельминтов, представленных в нашей коллекции, по географическим регионам России

Количество видов зоогельминтов, представленных в нашей коллекции, по странам Мира
| Страна | Число видов |
| Россия | 12730 |
| Туркмения | 403 |
| Киргизия | 345 |
| Беларусь | 267 |
| Вьетнам | 258 |
| Литва | 244 |
| Таджикистан | 181 |
| Казахстан | 154 |
| Грузия | 100 |
| Украина | 66 |
| Монголия | 61 |
| Латвия | 51 |
| США | 35 |
| Канада | 30 |
| Азербайджа́н | 21 |
| Эфиопия | 21 |
| Эстония | 19 |
| Чехия | 8 |
| Куба | 8 |
| Индонезия | 7 |
| Китай | 6 |
| Абхазия | 4 |
| Армения | 4 |
| Непал | 4 |
| Австралия | 3 |
| Великобритания | 3 |
| Япония | 3 |
| Новая Зеландия | 3 |
| Болгария | 3 |
| Узбекистан | 3 |
| Мексика | 2 |
| Намибия | 2 |
| Танзания | 2 |
| Филлипины | 2 |
| Сербия | 1 |
| Италия | 1 |
| Норвегия | 1 |
| Словакия | 1 |
| Нигерия | 1 |
| Бразилия | 1 |
| Франция | 1 |
| Германия | 1 |
В соответствии с расширенными функциональными возможностями локальной версии информационной системы Heminth_Sys, будет проведен систематического анализ паразитов по крупным таксонам ( класс, семейство, отряд, род,) и таксономический анализ хозяев, сравнительный анализа частот локализации паразитов в органах хозяева, проведен сравнительного географического анализа паразитафауны в различных природных зонах и крупных регионов как для России, а также для ЕврАзии в целом. Работа поддержана грантом РФФИ № 15-29-02528 офи-м «Инвентаризация коллекции паразитических червей Гельминтологического музея ИПЭЭ РАН и создание WEB–ориентированной информационно-поисковой системы в целях интеграции междисциплинарных исследований по систематике, морфологии, зоогеографии и эволюции этих организмов».

