ОСНОВНЫЕ НАПРАВЛЕНИЯ

Сотрудники кабинета

Подготовка образцов для молекулярно-генетических исследований

Методы молекулярно-генетической диагностики основаны на определении состава наследственного материала живых организмов (ДНК): выявлении различий между генотипами (участками генотипов), возникающих в результате случайных изменений (мутаций) и накапливающихся в ряду сменяющих друг друга поколений. Сравнительный анализ состава ДНК у представителей разных таксонов (подвидов, видов, родов и групп более высокого ранга) позволяет делать предположения об их филогенетических связях, а анализ частот встречаемости тех или иных генотипов (аллелей) в популяциях - о филогеографических и исторических аспектах: характере исторического расселения вида на территории современного ареала, степени изоляции существующих популяций, имевших место критических колебаниях численности, происхождение популяций от большего или меньшего числа особей-основателей и т.д. Не менее важной является и сама оценка генетического разнообразия популяций, позволяющая судить об их благополучии и устойчивости к возможным неблагоприятным изменениям среды.

Кабинет методов молекулярной диагностики ИПЭЭ РАН организован в 2003 г.

Основная задача кабинета - помощь в организации и проведении молекулярно-генетических исследований сотрудникам и аспирантам института, имеющим подобные задачи в плане работ. Сотрудники кабинета также проводят научные исследования по независимым тематикам.

Приборная база Кабинета включает автоматические генетические анализаторы (системы капиллярного электрофореза) производства фирмы Applied Biosystems: 3130 Genetic Analizator и ABI PRISM 310. Наличие данного оборудования позволяет проводить как прямое определение состава нуклеотидных последовательностей - секвенирование, так и генотипирование организма на основе присутствия разных (разной длины) аллелей того или иного локуса - фрагментный анализ.

Автоматические амплификаторы (термоциклеры) производства фирм Applied Biosystems, Biometra, Biokom и ДНК-Технлогия позволяют проводить полимеразную цепную реакцию (ПЦР) для значительного количества образцов и для разных условий.

Техническое оснащение Кабинета включает также ПЦР-боксы, центрифуги, системы электрофореза, трансиллюминаторы, термостаты и другое лабораторное оборудование, необходимое для проведения исследований.

Проведение исследований в кабинете финансируется (в рамках тех или иных конкретных проектов) грантами:

• программы фундаментальных исследований Президиума РАН "Биоразнообразие и динамика генофондов";
• программы фундаментальных исследований Отделения Биологических Наук РАН "Фундаментальные Основы Управления Биологическими Ресурсами";
• Российского Фонда Фундаментальных исследований;
• а также программами Постоянно действующей экспедиции РАН по изучению животных Красной книги Российской Федерации и других особо важных животных фауны России.

Индивидуальные генотипы гренландских китов (Balaena mysticetus) Охотского моря – база данных

© И.Г. Мещерский, А.Н. Чичкина, О.В. Шпак, В.В. Рожнов

© Институт проблем экологии и эволюции им. А.Н. Северцова РАН, 2013

скачать       Balaena_mysticetus_genotypes_rus.xls   Файл XLS (534 Кб)

Представлены результаты индвидуального генотипирования особей гренландских китов Охотского моря (анализ проб биопсии кожи): полные последовательности гена цитохрома b и контрольного региона митохондриальной ДНК; аллельный состав 14 микросателлитных локусов.

Разделы: Индивидуальные генотипы, Информация о праймерах, Гель-электрофорез, Информация об аллельных корзинах, Соответствие обозначений аллелей, Использованные источники, Благодарности

По мере анализа новых образцов предполагается регулярное дополнение базы.

При любом использовании представленных данных цитирование обязательно!

Порядок цитирования: Мещерский И.Г., Чичкина А.Н., Шпак О.В., Рожнов В.В. Молекулярно-генетическая характеристика гренландского кита (Balaena mysticetus L.) Охотского моря // Генетика. 2014. Т. 49. № 4 (в печати)

Приглашаем коллег сотрудничеству!

molecoldna@gmail.com

Последнее обновление: январь 2014